El Programa ha realizado una importante cantidad de estudios en sus distintas líneas de investigación, teniendo presencia en las 32 entidades federativas del país y en cada uno de los 3 órdenes de gobierno. También ha participado en proyectos e investigaciones promovidos por otras universidades e instancias públicas y privadas de orden nacional e internacional.
La evolución en las actividades de investigación que se reflejan en los enfoques y temáticas de los proyectos a lo largo del tiempo dan muestra del dinamismo de los procesos territoriales y de los caminos teóricos y metodológicos para abordarlos y discutirlos.
De esta manera en el historial de proyectos realizados por el PUEM se puede apreciar la renovación temática de la agenda científica y de gestión pública, así como de la necesidad de superar visiones fragmentadas o sectoriales en el análisis territorial.