Dentro de los departamentos se ubican las áreas de investigación, cada una de ellas conformada por académicos cuyo perfil es el de profesor-investigador, éstos realizan actividades de investigación alrededor de líneas comunes, participan en docencia a nivel de licenciatura y posgrado en áreas de su competencia y colaboran entre sí y con pares externos a la UAM-X por medio de redes interinstitucionales, nacionales e internacionales para facilitar sus actividades académicas y promover la difusión de la investigación.
Este modelo departamental ha favorecido la consolidación de los cuerpos académicos, quienes se organizan entre sí, al agruparse en 28 áreas de investigación en los cuatro departamentos.
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